如果出现反复流产、反复种植失败，以及部分高龄患者对于优生优育的考虑，需要进行囊胚植入前染色体筛查(PGS)筛选胚胎，对于染色体异常的患者，需要进行植入前染色体诊断(PGD)筛选胚胎。通过PGD/PGS对囊胚进行遗传学诊断，把健康的囊胚移植到母体中。

第三代试管婴儿PGD/PGS技术是通过取囊胚滋养层细胞作为活检材料，对囊胚的23条染色体进行检测，的胚胎师综合考虑囊胚形态及染色体等情况，筛选出优质囊胚来植入，从而避免因染色体异常而导致的胚停和流产，保证胎儿和母体的健康。

胚胎没过三代试管PGS和PGD基因筛查，是不能使用胚胎的。一般通过第三代试管婴儿的PGS筛查技术，可以得到三种胚胎：正常胚胎、异常胚胎、马赛克胚胎（一部分正常、一部分不正常）。如果所有培植的胚胎，送去做三代试管PGS和PGD基因筛查，都没有检测到正常胚胎，只有异常胚胎和马赛克胚胎的话，是不建议移植使用的，因为就算是移植成功了，胎儿也会有生化流掉的风险。

第三代试管婴儿PGD是在胚胎移植前，诊断单基因缺陷引发的疾病，而PGS是在胚胎移植前，全面筛查胚胎23对染色体的结构和数目。PGS与PGD采用的是相同的技术手段，又称“PGD非整倍体筛查”，他们相辅相成，目的都是选择不含致病基因、发育良好的胚胎，提高IVF成功率，最终得到健康宝宝的技术。一般不是所有人三代试管PGS和PGD基因筛查都能一次性通过，得到高质量胚胎的，如果胚胎没过可能是基因存在缺陷，这时这些没有通过胚胎是不能使用的，否则可能出现流产、胎儿畸形等情况。